Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BbxQ8VBW5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms