Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ApobrQ8VBT6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ApobrQ8VBT6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms