Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim29Q8R2Q0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms