Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A0

Gtf2f2, General transcription factor IIF subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f2Q8R0A0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2f2Q8R0A0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2f2Q8R0A0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms