Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms