Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf13Q8K2W6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf13Q8K2W6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf13Q8K2W6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf13Q8K2W6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf13Q8K2W6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf13Q8K2W6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf13Q8K2W6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf13Q8K2W6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf13Q8K2W6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf13Q8K2W6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf13Q8K2W6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf13Q8K2W6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf13Q8K2W6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf13Q8K2W6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Phf13Q8K2W6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Phf13Q8K2W6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Phf13Q8K2W6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Phf13Q8K2W6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Phf13Q8K2W6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf13Q8K2W6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms