Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paf1Q8K2T8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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