Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms