Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spire2Q8K1S6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms