Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc4a8Q8JZR6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc4a8Q8JZR6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc4a8Q8JZR6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc4a8Q8JZR6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms