Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rasgef1bQ8JZL7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rasgef1bQ8JZL7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rasgef1bQ8JZL7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Rasgef1bQ8JZL7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms