Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL2

Mchr1, Melanin-concentrating hormone receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mchr1Q8JZL2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mchr1Q8JZL2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms