Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syne4Q8CII8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syne4Q8CII8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms