Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH77

Nav1, Neuron navigator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav1Q8CH77 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nav1Q8CH77 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nav1Q8CH77 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms