Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp11Q8CFF0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp11Q8CFF0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms