Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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