Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Usp27Q8CEG8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Usp27Q8CEG8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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Usp27Q8CEG8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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Usp27Q8CEG8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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Usp27Q8CEG8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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Usp27Q8CEG8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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Usp27Q8CEG8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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Usp27Q8CEG8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Usp27Q8CEG8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms