Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms