Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fbxo48Q8CAT8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo48Q8CAT8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms