Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAI1

Ccdc142, Coiled-coil domain-containing protein 142, mousemouse

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Length 738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc142Q8CAI1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc142Q8CAI1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Ccdc142Q8CAI1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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