Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg4aQ8C9S8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg4aQ8C9S8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms