Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7D2

Crbn, Protein cereblon, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrbnQ8C7D2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CrbnQ8C7D2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CrbnQ8C7D2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms