Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms