Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5S7

Rec8, Meiotic recombination protein REC8 homolog, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rec8Q8C5S7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rec8Q8C5S7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rec8Q8C5S7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms