Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4X7

UPF0258 protein KIAA1024-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C4X7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C4X7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C4X7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C4X7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8C4X7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C4X7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8C4X7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8C4X7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8C4X7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8C4X7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8C4X7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C4X7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C4X7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C4X7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C4X7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C4X7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C4X7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C4X7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C4X7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C4X7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C4X7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C4X7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C4X7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C4X7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C4X7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C4X7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C4X7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms