Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm4aQ8BW72 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm4aQ8BW72 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm4aQ8BW72 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm4aQ8BW72 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm4aQ8BW72 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm4aQ8BW72 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm4aQ8BW72 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm4aQ8BW72 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm4aQ8BW72 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm4aQ8BW72 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm4aQ8BW72 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm4aQ8BW72 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm4aQ8BW72 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm4aQ8BW72 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm4aQ8BW72 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm4aQ8BW72 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kdm4aQ8BW72 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kdm4aQ8BW72 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4aQ8BW72 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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