Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms