Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms