Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPQ7

Sgsm1, Small G protein signaling modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgsm1Q8BPQ7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sgsm1Q8BPQ7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sgsm1Q8BPQ7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms