Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms