Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLF2

Cdkl3, Cyclin-dependent kinase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl3Q8BLF2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkl3Q8BLF2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl3Q8BLF2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl3Q8BLF2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl3Q8BLF2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl3Q8BLF2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl3Q8BLF2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl3Q8BLF2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms