Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms