Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prune1Q8BIW1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms