Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy1Q8BIJ7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy1Q8BIJ7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy1Q8BIJ7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy1Q8BIJ7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy1Q8BIJ7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy1Q8BIJ7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy1Q8BIJ7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy1Q8BIJ7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy1Q8BIJ7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy1Q8BIJ7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy1Q8BIJ7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy1Q8BIJ7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy1Q8BIJ7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy1Q8BIJ7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy1Q8BIJ7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rufy1Q8BIJ7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms