Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdca8Q8BHX3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cdca8Q8BHX3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdca8Q8BHX3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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