Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX3

Lrtm2, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm2Q8BGX3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms