Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms