Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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