Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Htatsf1Q8BGC0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htatsf1Q8BGC0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms