Protein–RNA interactions for Protein: Q810Q5

Nmes1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmes1Q810Q5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmes1Q810Q5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmes1Q810Q5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmes1Q810Q5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmes1Q810Q5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmes1Q810Q5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmes1Q810Q5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmes1Q810Q5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmes1Q810Q5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmes1Q810Q5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmes1Q810Q5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmes1Q810Q5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmes1Q810Q5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nmes1Q810Q5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms