Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms