Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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ChfrQ810L3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ChfrQ810L3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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