Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms