Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Amigo1Q80ZD8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Amigo1Q80ZD8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms