Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pcsk9Q80W65 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pcsk9Q80W65 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pcsk9Q80W65 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pcsk9Q80W65 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pcsk9Q80W65 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pcsk9Q80W65 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pcsk9Q80W65 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pcsk9Q80W65 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pcsk9Q80W65 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pcsk9Q80W65 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pcsk9Q80W65 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pcsk9Q80W65 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pcsk9Q80W65 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pcsk9Q80W65 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pcsk9Q80W65 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pcsk9Q80W65 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pcsk9Q80W65 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms