Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Cfap100Q80VN0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfap100Q80VN0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms