Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms