Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Actn1Q7TPR4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms