Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim17Q7TPM3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim17Q7TPM3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms