Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mycbp2Q7TPH6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms